HPV Detection and Genotyping in Vulvar Squamous Cell Carcinoma in Northern Thailand.

Siriaunkgul S, Settakorn J, Sukpan K, Srisomboon J, Utaipat U, Lekawanvijit S, Khunamornpong S.

Abstract: Background: The study was aimed to evaluate the prevalence and genotype distribution of HPV infection in vulvar squamous cell carcinoma (SCC) in northern Thailand and the clinicopathological difference with regard to HPV infection status. Materials and Methods: Formalin-fixed paraffin-embedded tissue samples of vulvar SCC diagnosed between January 2006 and December 2012 were collected. HPV infection was detected by nested polymerase chain reaction (PCR) with primers MY09/11 and GP5+/6+. HPV genotyping was performed using the Linear Array Genotyping Test, followed by type-specific PCR targeting the E6/E7 region of HPV16/18/52 if the Linear Array test was negative. The histologic slides of vulvar lesions and the medical records were reviewed. Results: There were 47 cases of vulvar SCC included in the study (mean patient age 57.9±13.2 years). HPV infection was detected in 29 cases (62%), all of which had single HPV infections. HPV16 accounted for 23 (49%). The patients with HPV-positive SCC had a significantly younger mean age than those with HPV-negative tumors (52.7 years vs 66.2 years, p<0.001). There was no significant difference in tumor stage distribution with regard to the status of HPV infection. The presence of vulvar intraepithelial neoplasia (VIN) of usual type (basaloid or warty) was significantly more frequent in HPV-positive cases compared with HPV-negative cases (62% vs 6%, p<0.001), whereas differentiated-type VIN was more common in HPV-negative cases (24% vs 0%, p=0.019). Conclusions: HPV infection was detected in 62% of vulvar SCC in northern Thailand. HPV16 was the predominant genotype similar to the data reported from other regions. HPV-positive SCC occurred in younger patients compared with HPV-negative SCC, and was associated with usual-type VIN. Vaccination against HPV16/18 may potentially prevent almost one half of vulvar SCC in northern Thailand.

PMID: 24870792 [PubMed - in process]
Asian Pac J Cancer Prev. 2014;15(8):3773-8.

Identification and characterization of small molecule human papillomavirus E6 inhibitors.

Malecka KA, Fera D, Schultz DC, Hodawadekar S, Reichman M, Donover PS, Murphy ME, Marmorstein R

Abstract: Cervical cancer is the sixth most common cancer in women worldwide and the leading cause of women's death in developing countries. Nearly all cervical cancers are associated with infection of the human papillomavirus (HPV). This sexually transmitted pathogen disrupts the cell cycle via two oncoproteins: E6 and E7. Cells respond to E7-mediated degradation of pRB by upregulating the p53 tumor suppressor pathway. However, E6 thwarts this response by binding to the cellular E6-Associating Protein (E6AP) and targeting p53 for degradation. These two virus-facilitated processes pave the way for cellular transformation. Prophylactic HPV vaccines are available, but individuals already infected with HPV lack drug-based therapeutic options. To fill this void, we sought to identify small molecule inhibitors of the E6/E6AP interaction. We designed an ELISA-based high throughput assay to rapidly screen compound libraries and hits were confirmed in several orthogonal biochemical and cell-based assays. Over 88,000 compounds were screened; 30 had in vitro potencies in the mid-nanomolar to mid-micromolar range and were classified as validated hits. Seven of these hits inhibited p53 degradation in cell lines with HPV-integrated genomes. Two compounds of similar scaffold successfully blocked p53 degradation and inhibited cell proliferation in cells stably transfected with E6. Together, these studies suggest that small molecules can successfully block E6-dependent p53 degradation and restore p53 activity. The compounds identified here constitute attractive starting points for further medicinal chemistry efforts and development into beneficial therapeutics.

PMID: 24854633
ACS Chem Biol. 2014 May 22.

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Complete genome sequences of three novel human papillomavirus types, 175, 178, and 180.

Johansson H, Forslund O

Abstract: We report the characterization of three novel human papillomavirus (HPV) types of the genus Gammapapillomavirus. HPV175 and HPV180 were isolated from a condyloma. HPV178 was isolated from healthy skin adjacent to an actinic keratosis.

PMID: 24855297 [PubMed]
Genome Announc. 2014 May 22;2(3). pii: e00443-14. doi: 10.1128/genomeA.00443-14.

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Cervical Cancer Screening: Docs Unconvinced on HPV DNA Test

The US Food and Drug Administration recently approved the use of a human papillomavirus (HPV) test as a primary cervical cancer screening test in women as young as 25 years, yet physicians are unlikely to ditch the Papanicolaou (Pap) test soon, experts say.

Roche's cobas test is 1 of 4 HPV tests on the market, but thus far it is the only one approved for primary screening, rather than for use in conjunction with Pap tests.

The cobas test was initially approved in April 2011 for women aged 21 to 29 years who had an abnormal Pap test and as a "co-test" with the Pap test for women aged 30 to 65 years. The test detects DNA from HPV 16 and HPV 18, the 2 types of HPV that cause 70% of cervical cancer cases worldwide, as well as for DNA from 12 other high-risk types of HPV.

If the cobas test is used as a primary screen, those who test positive for HPV 16 or HPV 18 are supposed to have a colposcopy, according to the FDA. If they test positive for 1 of the other high-risk HPV types, they are supposed to have a Pap test to determine whether they need colposcopy.

"I don't know that we're going to see an immediate change in how patients are screened for cervical cancer," Levi Downs, MD, a spokesman for the Society of Gynecologic Oncology and an associate professor of obstetrics and gynecology at the University of Minnesota School of Medicine, Minneapolis, said to Medscape Medical News.

"We have such a good test now," Dr. Downs said, referring to the Pap test, which physicians first began using in the 1940s. "We know that it has dramatically changed the impact of cervical cancer. Physicians, I think, are going to take their time in deciding what the data (about primary screening with an HPV test) mean."

Despite its approval, critical questions remain unanswered about the HPV test as a primary screening tool for cervical cancer, David Chelmow, MD, chair of obstetrics and gynecology at Virginia Commonwealth University in Richmond, told Medscape Medical News. For example, should women be screened more frequently or less frequently than current guidelines recommend for the Pap test? How should women aged 25 through 29 years be screened, given that the FDA approved cobas as a primary HPV test for those as young as 25 years, but current guidelines advise against routine use of an HPV test in women younger than 30 years? In addition, researchers do not yet know whether primary screening with the cobas test will lead to an increase in colposcopy and cervical biopsies compared with Pap screening.

Fuente: http://www.medscape.com/viewarticle/825263?src=soc_stm_edit

10 plataformas para realizar cursos online gratuitos

Coursera

Se trata de una plataforma que ofrece únicamente cursos gratuitos, pero de una gran calidad, pues se ha asociado con algunas de las universidades más importantes del mundo para impartirlos. Así, se pueden encontrar materias variadas, desde humanidades y ciencias sociales hasta medicina o biología, pasando por informática o formación empresarial. Entre los prestigiosos nombres de las entidades colaboradoras se pueden encontrar el de Stanford o el de la Universidad de Columbia.

Khan Academy

Este sitio es un proyecto educativo de ambiciones globales y sin ánimo de lucro. Su filosofía se basa en hacer que todos los recursos estén disponibles para cualquiera que los necesite. Hay un buscador para encontrar cursos online gratuitos sobre temas generales, con distintos niveles de dificultad. Su didáctica es admirable, sólo hay que echar un vistazo al material que ofrecen sobre la I Guerra Mundial para darse cuenta.

OpenCourseWare

Esta iniciativa educativa, impulsada por el MIT (Massachusetts Institute of Technology), ha adquirido gran relevancia en el plano internacional. A ella se ha adherido la Universidad Carlos III de Madrid, ofreciendo formación de nivel universitario y cursos cero para la introducción en una carrera.

Cursos abiertos de la UNED

La UNED, en su papel reconocido de universidad a distancia, también ofrece cursos online gratuitos. Hay que decir que éstos se encuadran dentro del proyecto OpenCourseWare. Pero no se trata de contenidos específicamente creados para impartir a través de este canal. La UNED ofrece sólo materias que se encuentran dentro de sus titulaciones oficiales. Eso sí, los estudiantes no reciben certificación válida.

AulaFácil

En este sitio se pueden encontrar cursos variados, desde idiomas hasta temáticas empresariales como contabilidad o diferentes campos de la informática, incluyendo lenguajes de programación, redes, análisis de datos.

Udacity

Operando bajo un esquema alejado de la seriedad que corresponde a las universidades, en Udacity se pueden encontrar lecciones apoyadas con recursos multimedia y en un tono ligero, aunque sin dejar de ser instructivo. Los cursos están agrupados en categorías concretas.

Open Culture

Desde el sitio de Open Culture se puede acceder a un buen número de cursos online gratuitos. No es una plataforma formativa al uso, pero alberga multitud de enlaces, clasificados en base al campo al que pertenece la materia que se imparte en ellos.

Floqq

Tampoco ésta es una plataforma al uso, pues Floqq no ofrece cursos como tal sino que facilita a terceros – centros académicos o expertos – que suban y den a conocer su oferta. Por tanto, en este site se encuentra todo tipo de formación, pues todo está aceptado.

BBC Learning English

Nadie pone en duda el prestigio de la BBC como medio de comunicación, pero su labor de difusión del inglés va más allá. La entidad británica ofrece cursos para aprender o perfeccionar esta lengua, con recursos variados y válidos para distintos niveles.

Duolingo

Si la anterior propuesta se refería sólo al inglés, en esta ocasión se trata de aprender el idioma que prefieras. En Duolingo aprovechan el aprendizaje que hacen unas personas para un proyecto de gran magnitud: traducir Internet. A medida que un estudiante progresa y hace sus ejercicios está contribuyendo a esta tarea.

Fuente: http://blogthinkbig.com/cursos-online-gratuitos-2/

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This Virtual-slides website has been developed in a partnership between University Paris Diderot and Hôpital St. Louis in Paris.

Its aim is to promote the use of microscopic virtual slides for students, teachers, researchers and clinicians.

PATHOBIN.

The perfect place for your pathology photography! Pathobin is an image hosting service and more. It is designed for pathologists, scientists, surgeons and students. Unlimited uploads of unlimited size. Pathology photography images are of educational and research value. Take photos with your phone, your microscope camera or even a flatbed scanner and upload full size images for free!. A case logbook: Maintain a visual record of all your cases, neatly categorized, stored safely and accessible from anywhere in the cloud. You can even export your log to common formats (such as .csv or excel). Perfect for registrars to track, store and share.

Simposio satélite de Patología Digital

Hotel Rafael Atocha, Madrid, 29 de mayo de 2014

Organiza: General Electric Healthcare

[Programa] [Descargar PDF] [Inscripción]

10:00-10:10 Introducción y presentación
Dr. Miguel Angel Piris. Presidente de la Sociedad Española de Anatomía Patológica
Dr. Marcial Gº Rojo. UGC Anatomía Patológica. Hospital de Jerez de la Frontera

Virtual Pathology en la Universidad de Leeds

The Virtual Pathology team at Leeds is dedicated to high quality digital slide scanning, hosting and research, with our data centre currently able to store 100TB of digital slide data.

• ST1 Histopathology Training NEW!
• Leeds Powerwall (a virtual reality microscope)
• 3-D Histopathology with virtual slides
• Leeds JISC Collection (the digitisation of three collections of pathology slides)
• EU guidelines for QA in pathology in colorectal cancer screening and diagnosis (Imaging library)
• Virchows Archiv (European guidelines for Pathology bowel cancer screening)

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NUEVA ETAPA EN LA REVISTA ELECTRÓNICA DE AUTOPSIA: LA AUTOPSIA UNE A LA ANATOMÍA PATOLOGÍA Y A LA PATOLOGÍA FORENSE
Joaquín S. Lucena Romero

Once años después de que viera la luz la Revista Electrónica de Autopsia / Electronic Journal of Autopsy (REA/EJA), en este 2014 iniciamos una nueva etapa con un nuevo equipo editorial fruto de la suma de esfuerzos entre el Club de Autopsias de la Sociedad Española de Anatomía Patológica (SEAP) y la Sociedad Española de Patología Forense (SEPAF).

En el cuatrienio 2009-2011, bajo la Presidencia del Dr. Aurelio Ariza, la SEAP inicia el acercamiento a la Sociedad Española de Citología (SEC) y a la SEPAF. La fructífera colaboración entre SEAP y SEPAF ha puesto en marcha una sinergia muy positiva pasando de la ignorancia mutua hasta la alianza estratégica. El congreso nacional de la SEAP y SEC (Sevilla 2009) y los congresos conjuntos SEAP-SEC-SEPAF (Zaragoza 2011 y Cádiz 2013) han proporcionado un impulso decidido en esa dirección [1].

Fue en el último Congreso de Cádiz en el que se sentaron las bases para que la colaboración mucho más estrecha en el ámbito de la autopsia y es esta práctica milenaria la que está sirviendo de punto de unión entre patólogos clínicos y forenses. La autopsia, a pesar del arsenal de exploraciones complementarias disponibles en la medicina actual, sigue siendo una fuente inagotable de información y conocimiento y este conocimiento tiene que ponerse al servicio de las especialidades clínicas y finalmente de la sociedad a la que todos nos debemos. Esta idea no es nueva y se encuentra indisolublemente unida al origen de la anatomía patológica. En el famoso teatro anatómico de Padua (Italia) realizado en 1584 bajo los auspicios del anatomista Fabrizio D´Acquapendente se puede leer esta inscripción grabada en la piedra sobre la puerta de entrada “Mors ubi gaudet sucurrere vitae”. Esta frase mantiene la misma vigencia después de más de cuatro siglos ya que “la sala de autopsias sigue siendo el lugar donde la muerte se alegra de ayudar a la vida” [2].

Pero paradójicamente, como se ponía de manifiesto en la Editorial del primer número de la REA/EJA, la tasa de autopsia ha descendido estrepitosamente en la mayor parte de los hospitales del mundo hasta llegar a alcanzar, en algunos sitios, cifras verdaderamente “alarmantes” [3]. Esta situación paradójica está convirtiendo a la autopsia forense casi en el único referente de la patología autópsica. Por ello, en muchos hospitales de España los residentes de anatomía patológica realicen una rotación externa por los servicios de patología forense para formarse adecuadamente en la práctica de las autopsias.

Con este objetivo de integración entre SEAP y SEPAF, a partir de este número de la REA/EJA hemos constituido un Comité Editorial paritario y representativo de los dos mundos: autopsia clínica y autopsia forense. El objetivo que nos hemos marcado para los próximo años es aumentar progresivamente el número de artículos en cada volumen hasta llegar a una periodicidad trimestral. La edición digital y un proceso editorial on line permiten que los contenidos de la revista puedan verse actualizados con gran rapidez evitando así el retraso que supone la edición impresa. También estamos trabajando para dar la máxima visibilidad a la REA/EJA y que sus contenidos aparezcan indizados en el mayo número posible de bases de datos. En este sentido acabamos de firmar un acuerdo con EBSCO para que los contenidos de la revista puedan ser consultados y descargados en esta prestigiosa base de datos [4]. Otra novedad es que se podrán enviar artículos no solo en Español sino también en Inglés y Portugués con la obligatoriedad de que en estos dos últimos idiomas el resumen y las palabras clave aparezcan en Español.

Pero, evidentemente, el trabajo y el impulso del Comité Editorial no tendrán ningún valor si los auténticos protagonistas de esta historia, es decir vosotr@s no dais contenido a la revista enviando artículos que son el auténtico motor que mueve a cualquier publicación científica. Por tanto, esperamos las aportaciones de todos los que desde diferentes ámbitos nos dedicamos a esta apasionante actividad, tanto desde la patología clínica o forense como desde aquellas otras disciplinas afines que son indispensables para poder interpretar adecuadamente los hallazgos de la autopsia: toxicólogos, biólogos, microbiólogos, antropólogos, odontólogos, entomólogos, etc.

En nombre del Comité Editorial, os envío un cordial saludo

TEXTO COMPLETO: PDF - Revista Electrónica de la Autopsia

REFERENCIAS

1.- Ariza A. Patología Clínica y Forense. Desde la ignorancia mutua a la alianza estratégica. X Curso de Patología Forense. Edita Consejería de Salud, Gobierno de La Rioja. Logroño, 2013. pp. 297-302.
2.- Lucena J. Ser médico y......patólogo forense. Rev Clin Esp 2014 (en prensa).
3.- Fernández F. Editorial. REA :: EJAutopsy 2003;1:1.
4.- EBSCO. http://www.ebsco.com

About Micro to tele: I am a senior biomedical scientist working in a diagnostic histopathology lab in London, currently training for my Diploma of Expert Practice in Histological Dissection. I am passionate about molecular diagnostics, raising awareness of recognising pathological symptoms & processes and the importance of early detection. I also have a keen interest in oncogenesis, epigenetics and astronomy.

Blog Micro to tele: http://micro2tele.com/

El Colegio Americano de Patólogos CAP ha editado este póster para explicar cual es el papel que juegan los Patólogos en el sistema sanitario y la repercusión de su trabajo en la atención asistencial.

Echa un vistazo al Tweet de @Pathologists: https://twitter.com/Pathologists/status/459748680552050688

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Echa un vistazo al Tweet de @Roche

#FDA approves our #HPV test as first ever alternative to Pap smear to detect women at high risk for #cervicalcancer

Más información en: http://www.hpv16and18.com

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Información del Instituto Nacional del Cancer de los EEUU en relación con el Despistaje del Carcinoma de Cuello Uterino. Información para pacientes sobre los Exámenes de detección del cáncer de cuello uterino (PDQ®).

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The history of pathology informatics: A global perspective

Seung Park, Anil V. Parwani, Raymond D. Aller, Lech Banach, Michael J. Becich, Stephan Borkenfeld, Alexis B. Carter, Bruce A. Friedman, Marcial Garcia Rojo, Andrew Georgiou, Gian Kayser, Klaus Kayser, Michael Legg, Christopher Naugler, Takashi Sawai, Hal Weiner, Dennis Winsten, and Liron Pantanowitz

Abstract: Pathology informatics has evolved to varying levels around the world. The history of pathology informatics in different countries is a tale with many dimensions. At first glance, it is the familiar story of individuals solving problems that arise in their clinical practice to enhance efficiency, better manage (e.g., digitize) laboratory information, as well as exploit emerging information technologies. Under the surface, however, lie powerful resource, regulatory, and societal forces that helped shape our discipline into what it is today. In this monograph, for the first time in the history of our discipline, we collectively perform a global review of the field of pathology informatics. In doing so, we illustrate how general far-reaching trends such as the advent of computers, the Internet and digital imaging have affected pathology informatics in the world at large. Major drivers in the field included the need for pathologists to comply with national standards for health information technology and telepathology applications to meet the scarcity of pathology services and trained people in certain countries. Following trials by a multitude of investigators, not all of them successful, it is apparent that innovation alone did not assure the success of many informatics tools and solutions. Common, ongoing barriers to the widespread adoption of informatics devices include poor information technology infrastructure in undeveloped areas, the cost of technology, and regulatory issues. This review offers a deeper understanding of how pathology informatics historically developed and provides insights into what the promising future might hold.

PMC: 3714902

J Pathol Inform. 2013; 4: 7. May 30, 2013. doi: 10.4103/2153-3539.112689