Patología Digital

XXIV Congreso de la Sociedad Española de Anatomía Patológica
XIX Congreso de la Sociedad Española de Citología

Sevilla, 20 a 23 de mayo de 2009

El actual Coordinador del Club de Informática Aplicada de la SEAP, Luis Alfaro, nos informa que se está preparando una Actividad del Club en el próximo Congreso de la SEAP a celebrar el miércoles 20 de mayo de 2009 16:30-18:30 h.

En sucesivas entradas informaremos sobre los contenidos que se van a tratar en ésta actividad.
Disponen de más información sobre éste congreso en la URL:

12th European Congress on Digital Pathology

12th European Congress on Digital Pathology

previously European Congress on Telepathology and International Congress on Virtual Microscopy

Worldwide INDUSTRY, RESEARCH and CLINICS participants:

   - Business processes in Pathology: hospital integration, telepathology, e-learning
   - Imaging technological advances: WSI, molecular imaging, label free technologies...
   - Image analysis, knowledge formalization and modeling

Organized under the presidency of Catherine Guettier SFP (French Society of  Pathology), honorary president, Etienne Martin with the contribution of ADICAP (Association for Developing Informatics in Cytology and Anatomic Pathology), Frédérique Capron and GFHC (French Group for Cellular Haematology),
Xavier Troussard.

Dear Sir / Madam,

we would like to invite you to the 12th European Congress on Digital Pathology, previously kwown as European Congress on Telepathology and International Congress on Virtual Microscopy, to be held in Paris, France from 18 to 21 June 2014.

Pathology switch from analogue to digital is at the centre of the Congress, as shown in the agenda below. This congress represents a great chance to learn about latest and future innovations and we warmly invite you, your colleagues and partners to attend this biennial European event with participants from all over the world.

This edition of the Congress is organized under the presidence of Catherine Guettier SFP (French Society of Pathology), honorary president, Etienne Martin
with the contribution of ADICAP (Association for Developing Informatics in Cytology and Anatomic Pathology), Frédérique Capron and GFHC (French Group for Cellular Haematology), Xavier Troussard.


Abstracts submission deadline: 20 January 2014

- Contributors are invited to submit an abstract (max. 400 words) written in English for oral and poster presentations on all research fields related to digital pathology, telepathology, image analysis. Specific topics include (and are not limited to) the topics from the provisional agenda underneath.

- Submission should be done electronically at the following link: before 20 January 2014

- In addition, contributors who also aim at individually Pubmed indexed articles shall submit an extended abstract (less than 1500 words). Selected articles will be published either in "Diagnostic Pathology" (editor-in-chief Klaus Kayser, co-chairs Catherine Bor, Philippe Camparo and Myriam Oger) or for computer science oriented articles in the "Computerized Medical Imaging and Graphics" Elsevier journal (editor-in-chief Daniel Racoceanu, co-chair Philippe Belhomme)

NEW! Pecha kucha - a great opportunity for young scientists and creative senior researchers!
Pecha kucha is a special form for very dynamic and exciting presentations. You will have the chance to present your topic/idea/projects (no limits!) for discussion, idea mining and potential collaborators.
The rules of Pecha kucha are very simple: you have 20 slides, for each slide exactly 20 seconds to speak (for the complete presentation 6 min 40 sec). For this session maximal seven words per slide are allowed, you have to use images, figures and diagrams to present you scientific topic, question, idea and/or opinion. This strict format keeps presentations creative, concise and fast-paced and avoids the "Powerpoint-Death"Â (more details:
Please send only your name and title of the Pecha kucha-Presentation to: - no abstracts are necessary.

Organizing committee co-chaired by Jacques Klossa and Philippe Bertheau: Philippe Belhomme; Catherine Bor; Philippe Camparo; Odile Crepin; Christel Daniel; Bettina Fabiani; Vincent Leymarie; Daniel Lusina; Michel Manfait; Etienne Martin; Myriam Oger; Daniel Racoceanu; Thomas Schrader; Béatrice Vergier

Scientific advisory board co-chaired by Klaus Kayser, Catherine Bor and Daniel Racoceanu

Provisional agenda

Wednesday 18 June, 2014
IHE/DICOM joint meeting and at the same time "Young colleagues training session"
Congress opening at 18:00

Thursday 19 June, 2014
Keynote on telepathology
- Telepathology
- Image analysis
- Digital pathology / Virtual microscopy / Technological advances
- Posters presentation and session - PECHA KUCHA for young students

Friday 20 June, 2014
Keynote on knowledge formalization
- Knowledge formalisation
- E- learning
- Image analysis
- Posters presentation and session - PECHA KUCHA for young students

Saturday 21 June, 2014
Keynote on data mining and modeling
- Data mining
- Models in pathology
- Quality of experience

Organizing Secretariat

the office

in collaboration with
Meeting di Sara Zanazzi

For any further information or request, please visit the Congress website or contact the Organizing Secretariat.

Best regards,

Luciana Biecker

400 comandos para linux

Tips: Más de 400 comandos para GNU/Linux que deberías conocer

Admin Eusalud

ASCO slide library

ASCO Slide Library

Admin Eusalud

Base de datos de marcadores para IHQ

Pathpedia: Database of immunohistochemical markers

Admin Eusalud

Buscadores de Imágenes Médicas

Dos tutoriales muy recomendables de la Universidad de Yale bajo el nombre "Finding Medical Images Part I and Part II" explican como encontrar imágenes biomédicas cuando queremos ilustrar una presentación convenientemente.

AVISO: Tutoriales desactualizados. Los vínculos han caducado.
Abril, 2020

Resumimos los principales enlaces aquí referidos:


* Brain
* SpringerImages
* MDConsult
* Access Medicine McGraw Hill
* The New England Journal Medicine - Images in clinical medicine
* American Society of Hematology - ASH Image Bank

* Centers for Disease Control and Prevention - Public Health Image Library
* National Cancer Institute - Visuals Online
* National Institutes of Health - Image Bank
* National Eye Institute - Search NEI Photos, Images & Videos
* National Human Genome Research Institute
* National Institute of Alergy and Infectius Diseases - Image Library
* National Institute of Arthritis and Musculosskeletal and Skin Diseases - Image Gallery
* National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases - Image Library
* National Institute of Environmental Health Sciences
* National Insitute of General Medical Sciences - Image Gallery
* National Institute of Mental Health - Image Library
* U.S. National Library of Medicina - Images of History of Medicine

* SecondSlide - The Juan Rosai Collection of Surgical Pathology Seminars (1945-present)
* Virtual Slides on Diagnostic Pathology
* The Virtual Slidebox - Virtual Microscopy Universidad de Iowa
* WebMicroscope - European network for virtual microscopy

* Google Imágenes. Se pueden hacer búsquedas tanto por texto como por una imagen modelo

AVISO Abril 2020: Algunos de los vínculos de esta página han caducado.

Curso de Microscopía Virtual, Telepatología, e Informática Médica

Curso de Microscopía Virtual, Telepatología, e Informática Médica


* La unidad de Anatomía Patológica de la Fundación Oftalmológica del Mediterráneo
* El Club de Patología Digital de la Sociedad Española de Anatomía Patológica

Valencia, 24, 25 y 26 de Noviembre de 2011

Objetivos: El curso se desarrollará en el salón de actos de la Fundación Oftalmólogica del Meditterráneo de Valencia. Estará basado en presentaciones tipo PowerPoint de treinta minutos, con una orientación práctica, de forma que los asistentes puedan aplicar en sus lugares de trabajo el contenido de las conferencias. La cuota de inscripción incluye además de la asistencia a las sesiones, dos comidas de trabajo los días 24 y 25 de noviembre, y los cafés en los descansos de la sesiones. Tiene un total de 20 horas lectivas, y se entregará un certificado de asistencia, y un DVD con el contenido de la sesiones. El curso pretende mostrar los beneficios que las tecnologías de la información y telecomunicaciones aportan, como en muchos otros campos, a nuestra especialidad, así como la importancia de la creciente digitalización en patología. E intenta también instruir en las nociones básicas de Informática que los patólogos deben conocer para poder sacar el máximo partido de los avances tecnológicos. Contamos como ponentes con un grupo de patólogos con experiencia en la materia, informáticos, y empresas que expondrán sus equipos y soluciones de Patología Digital.


Data Science Toolbox

Start doing data science in minutes

Data Science Toolbox

As a data scientist, you don't want to waste your time installing software. Our goal is to provide a virtual environment that will enable you to start doing data science in a matter of minutes.

As a teacher, author, or organization, making sure that your students, readers, or members have the same software installed is not straightforward. This open source project will enable you to easily create custom software and data bundles for the Data Science Toolbox.

Debian 7 Wheezy para mayo

Debian 7 llegará en la primera semana de mayo

Comunicado oficial

Admin Eusalud

Global Engage's. Digital Pathology Congress 2014


2014 Agenda Just Launched Download the PDF Brochure

Early Registration - delegates save 20% with discount code:NN/EB/20 Offer ends Friday 1 August, 2014*

| Speakers | Free Newsletter | Register today |

Dear If you are involved with Pathology then you are standing at the frontier of fundamental change in technology that will have a huge impact on health care strategies, health care delivery and work patterns. Understanding how is essential.

"Once data is available digitally, it opens up huge opportunities to redesign process-driven services to create patient-centric care systems. Digitally enabled laboratory medicine services have the potential to bring pathologists closer to patients and so to speed up and improve the patient experience."

Pathology Programme NHS

To secure these benefits, investment into Digital Pathology by health service providers is growing world-wide.

By coming to this outstanding meeting you will discover how Digital Pathology is already reducing lab costs, increasing workflow efficiency, creating greater inter-connectivity and delivering more effective training! Additionally, you will learn how digital pathology can improve decision making to enable
enhanced and personalised patient care.

The Digital Pathology Congress has been designed to target the following strategic and scientific key areas:

  • Digital Pathology - Strategy and Technology
  • Pathology Informatics
  • Telepathology
  • Digital Image Analysis
  • Digital Pathology
  • Application and Research Case Studies

  • Confirmed Speakers include:


    JoMartin, National Clinical Director of Pathology NHS England, Professor of Pathology, Queen Mary University of London, Director of Academic Health Sciences, Barts Health NHS Trust

    Liron Pantanowitz, Associate Professor of Pathology & Biomedical Informatics, Director of the Pathology Informatics Fellowship Program and Associate Director of the Pathology Informatics Division at the University of Pittsburgh Medical Center, USA

    Marcial Garcia Rojo, Head of Pathology Department. Hospital de Jerez de la Frontera, Cádiz, Spain
    Also speaking:

    Klaus Kayser, Professor, Institute of Pathology, Humboldt University, Germany
    Paul van Diest, Department of Pathology, University Medical Center Utrecht, Netherlands
    Yukako Yagi, Director of Pathology Imaging and Communication Technology Center, Massachusetts General Hospital and Harvard Medical School, USA
    Toby Cornish, Assistant Professor of Pathology, Division of Gastrointestinal
    and Liver Pathology, Johns Hopkins School of Medicine, USA
    Mogens Vyberg, Professor of Clinical Pathology, University of Aalborg, Denmark
    Jeroen van der Laak, Assistant Professor Pathology, Radboud University, The
    Tania Roskams, The Translational Cell and Tissue Research Group, KU Leuven, Belgium
    Sebastian Brandner, Professor and Chair of Neuropathology, Division of Neuropathology, The National Hospital for Neurology and Neurosurgery, and Dept. of
    Neurodegenerative Disease, UCL Institute of Neurology, UK
    Daniel Racoceanu, Professor, Sorbonne Universités, Université Pierre et Marie
    Curie (UPMC) & Adjunct Professor, National University of Singapore (NUS)
    Johan Lundin, Research Director and Professor of Medical Technology, Institute for Molecular Medicine Finland (FIMM), Helsinki, Finland and Karolinska
    Institutet, Stockholm, Sweden
    Arvydas Laurinavičius, National Pathology Center, Vilnius University Hospital
    Santariskes Clinics, Lithuania
    Will Howat, Head of Histopathology/ISH, Cancer Research UK
    Marielle Odin, Director of Pathology, Roche, Germany
    David Snead, Consultant Histopathologist and Clinical Service Lead, Coventry and Warwickshire Pathology Services, UK
    Gloria Bueno, Lecturer and Principal Research at School of Engineering,
    Universidad de Castilla-La Mancha, Spain
    Niels Grabe, Head, Hamamatsu Tissue Imaging and Analysis Center, Heidelberg University, Germany
    Frederick Klauschen, Head, Systems Pathology Group, Einstein Junior Fellow, Institute of Pathology, Charité University Medicine Berlin, Germany
    Friedrich Feuerhake, Neuropathologist, Institute of Pathology, Hannover Medical School, Germany
    Jorma Isola, Professor of Cancer Biology, University of Tampere, BioMediTech,
    Michael den Bakker, Consultant Histopathologist Department of Pathology, Maasstad Hospital, The Netherlands
    Sanja Stifter, Associate Professor, Department of Pathology, Faculty of
    Medicine, University of Rijeka, Croatia
    Register online ....
    Read the full agenda.....
    Click here to forward this email to a friend

    * Solution Providers (technology manufacturers/vendors, industry consultants etc)
    please contact Steve Hambrook, Conference Director for the Digital Pathology Congress, before registering:
    +44 (0) 1865 849841

Herramientas para la docencia

Las 50 mejores herramientas online y gratuitas para profesores en 2014

II Curso de Patología Digital

Avisos y convocatorias:

II Curso de Patología Digital. Convocatoria.

II Curso de Patología Digital

Hospital General Universitario de Ciudad Real

Fecha de inicio:
29 de noviembre de 2012
Fecha de finalización:
30 de noviembre de 2012

Más información:
Le invitamos cordialmente a participar en el II Curso de Patología Digital, que se celebrará en Ciudad Real, los días 29 y 30 de noviembre de 2012, bajo los auspicios científicos del Club de Patología Digital de la Sociedad Española de Anatomía Patológica (SEAP) y la Sociedad Española de Informática de la Salud (SEIS).

El II Curso de Patología Digital han incorporado talleres prácticos y nuevos temas como la educación y formación continuada, innovaciones tecnológicas, como cloud computing o el uso de tabletas y smartphones, e interesantes debates sobre el impacto que la informática tendrá en la organización interna de los servicios de anatomía patológica en un futuro próximo.

El curso está dirigido, fundamentalmente, a técnicos especialistas de anatomía patológica y a patólogos.


III Curso de Patología Digital, noviembre 2014

III Curso de Patología Digital

III Curso de Patología Digital

Jerez de la Frontera, Cádiz

26 a 28 de noviembre de 2014

IV Curso de Patología Digital, octubre 2015

IV Curso de Patología Digital


Valencia 29, 30 y 31 de Octubre de 2015. Inscripción

Imagen Médica nuevo software CaloPix

TRIBVN CaloPix Workstation CE Marked as a software for medical imaging management and display | The Digital Pathology Blog

Admon Eusalud

Imagen digital y sistemas de información en patología

El CLUB DE PATOLOGÍA DIGITAL celebrará la actividad Imagen digital y sistemas de información en patología en el contexto del XXVI Congreso Nacional de la SEAP-IAP. La reunión se celebrará el 22 de abril de 2013 en Cadiz de 14.30-16.30 h en la sede del Congreso: Palacio de Congresos y Exposiciones de Cádiz, Calle Plocia s/n (Junto a la Estación de Ferrocarriles y el Muelle de Cádiz).

Coordinador: Dr. Félix Conde
Hospital Universitario Infanta Cristina. Badajoz

* Utilización de imágenes digitales completas en la rutina diaria
Dr. Eduardo Alcaraz Mateos. Hospital Universitario Morales Meseguer. Murcia

* Imagen digital para una patología digital
Dr. Luis Alfaro Ferreras. Fundación Oftalmológica del Mediterráneo. Valencia

* Redes sociales y patología
Dr. Manuel Manrique Celada. Hospital de Zumárraga. Guipúzcoa

* Tratamiento de imágenes con powerpoint
Dr. Pascual Meseguer García. Hospital de Xátiva. Valencia

* Gestión de revistas electrónicas con Open Journal Systems (O.J.S.)
Dr. Ernesto Moro Rodríguez. Universidad Rey Juan Carlos - Madrid

* Redes de Telepatología: Trabajando junto con el informático
Dr. Juan Ruiz Martín. Hospital Virgen de la Misericordia. Toledo

Leeds Virtual Pathology

Virtual Pathology (@LeedsPathology) twitteó a las 0:42 PM on jue, ene 03, 2013:
Happy New Year. 5000 slides in the slide library!

Created with Drupal Editor

Linux en la práctica de la Patología: Introducción

A solicitud de nuestro coodinador del Club de Informática Aplicada de la SEAP he preparado la siguiente presentación Linux en la práctica de la Patología para la Sesión del Club en el XXIV Congreso de la SEAP: "Como puede la informática ayudar a los patólogos".

Supongo que Luis, al asignarme éste cometido conocía con antelación que si, yo utilizo a diario LINUX tanto en el ordenador de trabajo de mi despacho y algún otro servidor dispuesto en nuestro laboratorio, como en casa. Esto no quiere decir que sea usurario de Linux en exclusiva porque varios de los ordenadores con los que trabajo disponen de un arranque dual tanto para Linux como para Windows.

En relación con el ordenador institucional de la Universidad si tengo que adelantar que me lo entregaron con Windows XP preinstalado y que a solicitud del Servicio de Informática se me permitió utilizar una partición de 22 Gb del disco duro para instalar la distribución de Debian. Inicialmente en aquella época la versión 3.0 "woody" de 2002 y sucesivamente he ido actualizando las versiones hasta la 5.0 "lenny" del 15 de febrero de 2009.

Antes de empezar a desarrollar el tema que me compete quisiera atraer su atención sobre lo que los patólogos pensamos sobre qué es LINUX, ¿qué idea tenemos sobre éste sistema operativo?, por ejemplo. Hace algún tiempo ya, en la lista PATHOL-L uno de los co-listeros, Sachin Kale de Maharashtra, India, lanzó al foro la siguiente pregunta: "Anybody having experience with Linux?". Lejos de parecer un tópico fuera de contexto en una lista de patología fueron varias las respuestas y discusiones que se suscitaron. De forma rápida podemos resumirlas en las siguientes:

Etc ..

De lo expuesto podemos resumir los siguientes hechos: "es capaz de detectar mucho hardward", "me causa miedo utilizarlo", "es muy estable", "son gratuitos y menos vulnerables a virus y spyware", "hay una gran variedad de programas con licencia libre", "la instalación es fácil", "se necesita una curva de aprendizaje" ....

A continuación intentaremos adentrarnos un poco más en el mundo Linux y explicar que puede esperar un patólogo de éste SO.

Introduction to Linux | an edX Course

LFS101x  | Introduction to Linux

Introduction to Linux is a edX Course (follow the link)

School: LinuxFoundationX
Course Code: LFS101x
Classes Start: 1 Aug 2014
Estimated effort: Most users will find that thoroughly covering the material will take anywhere from 40 to 60 hours

Develop a good working knowledge of Linux using both the graphical interface and command line, covering the major Linux distribution families.

About this Course

Linux powers 94% of the world’s supercomputers, most of the servers powering the Internet, the majority of financial trades worldwide and a billion Android devices. In short, Linux is everywhere. It appears in many different architectures, from mainframes to server to desktop to mobile and on a staggeringly wide variety of hardware.

This course explores the various tools and techniques commonly used by Linux programmers, system administrators and end users to achieve their day-to-day work in a Linux environment. It is designed for experienced computer users who have limited or no previous exposure to Linux, whether they are working in an individual or Enterprise environment.

Upon completion of this training you should have a good working knowledge of Linux, from both a graphical and command line perspective, allowing you to easily navigate through any of the major Linux distributions. You will be able to continue your progress as either a user, system administrator or developer using the acquired skill set.

Los mejores comandos gnulinux

Los mejores comandos para GNU/Linux que deberías conocer

Autor: Ruben Andrés.

Usar el terminal en Ubuntu o en cualquier otra distribución GNU/Linux es uno de los grandes temores de aquellos usuarios que se inician en el descubrimiento de los sistemas operativos de software libre y abierto, que suelen estar más acostumbrados a las interfaces gráficas que a las líneas de comandos.

Sin embargo, conocer los comandos más básicos de Linux puede evitarte pasar por un laberinto de ventanas para llevar a cabo cualquier configuración o cambio en el sistema que, desde el terminal, tan solo supondría escribir algún que otro comando, siendo al final incluso más sencillo recordar el comando y hacerlo desde el terminal que aprenderse la ruta de ventanas hasta llegar a la opción que permite realizar el mismo cambio desde la interfaz gráfica.

Sigue leyendo...

Comandos para información y apagado del sistema

En ocasiones, puedes necesitar conocer algunos detalles sobre tu ordenador, configuraciones de tu sistema operativo y sus componentes para instalar un determinado tipo de programas o para monitorizar su rendimiento de tu ordenador.

Esta información sobre tu equipo está accesible desde la interfaz gráfica, pero con estos comandos obtendrás la información de tu sistema desde el terminal de Linux de una forma mucho más rápida que desde la interfaz gráfica.

Escribiendo en un terminal de Linux el comando adecuado se mostrará inmediatamente la información sobre el componente o del proceso que necesitas, y sin necesidad de navegar por todo el sistema.

Cómo crear una Live-USB para una distro Linux

Los 5 mejores reproductores multimedia para Linux

Utilizando los comandos adecuados también podrás forzar el apagado o reinicio de tu ordenador desde el terminal de Linux. Esto, en ocasiones puede ser incluso más útil que hacerlo desde la interfaz gráfica ya que, por ejemplo, podrás programar el apagado de tu equipo para más tarde algo que desde la interfaz gráfica requiere instalar un software adicional.

cd /home/usuario: Te llevará directamente hasta la ruta que indiques, en este caso hasta el directorio “usuario”.

  • cd ..: retrocederás un nivel en la jerarquía de directorios.
  • cd ../..: retrocederás 2 niveles en la jerarquía de directorios.
  • cd: te llevará al directorio raíz de esa unidad.
  • cd ~usuario: irás al directorio principal del usuario que indiques.
  • cd –: regresarás al directorio anterior.
  • pwd: mostrará la ruta del directorio donde te encuentras actualmente.
  • ls: mostrará los archivos y carpetas del directorio donde te encuentras.
  • ls -l: mostrara los detalles de archivos y carpetas del directorio actual.
  • ls -a: mostrará los archivos ocultos del directorio actual.
  • mkdir Directorio: creará una nueva carpeta o directorio con nombre que le indiques. En este caso, “Directorio”.

  • mkdir Directorio1 Directorio 2: creará dos carpetas simultáneamente.
  • rmdir Directorio: borrará la carpeta llamada “Directorio”.
  • rm -rf Directorio: eliminará una carpeta llamada “Directorio” y todo su contenido.
  • mv Viejodirectorio Nuevodirectorio: renombrará o moverá un archivo o carpeta.
  • cp Archivo: copiará un archivo.
  • cp Archivo1 Archivo2: copiará dos archivos simultáneamente.
  • cp -a Directorio: copiará una carpeta completa, en este caso “Directorio”.
  • cp -a Directorio1 Directorio2: copiará dos directorios simultáneamente.
  • ln -s Archivo Enlacearchivo: creará un enlace simbólico con un determinado nombre, al archivo o directorio indicado.
  • ln Archivo Enlacearchivo: creará un enlace físico con el nombre indicado al archivo o directorio indicado.
  • Comandos para paquetes con formato .DEB (Debian, Ubuntu y derivadas,etc.):

    Gestor de paquetes APT

    Fuente: ComputerHoy

    Microscope Software

    NCI Tech Transfer (@NCITechTransfer) twitteó a las 7:20 PM on vie, feb 15, 2013:
    NCI seeks partners for Microscope Software for Cancer Diagnosis, a set of tools for assays on new unseen datasets.
    Admin Eusalud

    MicroscopyU: The source for microscopy education.

    Patrocinado por Nikon en este sitio encontrará Galerías de Imágenes, Tutoriales relacionado con la microscopía, artículos y otro material iconográfico útil en docencia.


    NIH VideCasting y PodCasting

    NIH VideoCasting and Podcasting

    Admin Eusalud

    Nueva actualización de Debian 7.2

    Updated Debian 7: 7.2 released

    12 de octubre 2013

    El proyecto Debian se complace en anunciar la segunda actualización de su distribución estable Debian 7 (codename wheezy). Esta actualización agrega principalmente correcciones para problemas de seguridad a la versión estable, junto con algunos ajustes para problemas graves. Otrasr recomendaciones de seguridad ya se han publicado por separado y se hace referencia a ellas cada vez que esten disponibles.

    Por favor, tenga en cuenta que esta actualización no constituye una nueva versión de Debian 7, que sólo actualiza algunos de los paquetes ya incluidos.

    Aquellos que con frecuencia suelen instalar actualizaciones de no tendrán que actualizar muchos paquetes y la mayoría de las actualizaciones de están incluidas en esta actualización.

    Actualizar a esta revisión en línea se suele hacer apuntando la aptitud (o apt ) paquete de herramientas (ver el sources.list en el manual) para uno de los muchos FTP de Debian o réplicas HTTP. Una lista completa de los espejos está disponible en:

    Admin Eusalud


    OpenSlide is a C library that provides a simple interface to read whole-slide images (also known as virtual slides). The current version is 3.4.1, released 2015-04-20.

    Python and Java bindings are also available. The Python binding includes a Deep Zoom generator and a simple web-based viewer. The Java binding includes a simple image viewer.

    OpenSlide and its official language bindings are released under the terms of the GNU Lesser General Public License, version 2.1.


    Fuente: OpenSlide

    Optimiza Linux

    Una forma recomendable de progresar en la curva de aprendizaje de Linux es suscribirse a alguna de las muchas revistas especializadas que existen. Yo aconsejo Todo Linux de Iberprensa. Esta revista incluye muchos reportajes, talleres prácticos, cursos, análisis de software, además de entregar con cada número un DVD con las actualizaciones más recientes de las distros más conocidas. Uno de los cursos prácticos que he leído últimamente llevaba el titulo de Optimiza Linux.

    Optimiza Linux: Una vez que tenemos instalado y funcionando nuestro sistema GNU/Linux es hora de plantearse qué podemos hacer para mejorar el rendimiento y la eficiencia del mismo. En general, se trata de obtener un sistema que se ajuste perfectamente a una serie de requisitos, logrando que funcione de la forma más eficiente posible. Todo Linux ha elaborado un reportaje en su número 104 donde muestra una serie de técnicas y procesos que pueden ayudarnos a correr de forma robusta y eficiente nuestro Linux. Aborda como optimizar el sistema, particularmente compilando el kernel de forma lo personalizada posible. Podemos ejecutar el comando dmesg para ver toda la información del sistema obtenida por el kernel durante el arranque, y en base a esta información ajustarlo a nuestras necesidades. Es habitual que en nuestro sistema estén corriendo también una serie de servicios (procesos en segundo plano que se lanzan cuando arrancamos el sistema). Es posible que algunos de estos servicios esté de más y que no los necesitemos. Para ver los servicios que están corriendo en nuestro máquina podemos utilizar el comando chkconfig. Otro aspecto de la optimización es el empleo de herramientas de monitotización. Entre estas contamos con ps y top. Utilizando los argumentos aux junto al comando ps [ps ax] podemos ver información sobre los procesos que se estén ejecutando. Por otro lado top nos indica la actividad del sistema, refrescando la información cada segundo. Para monitorizar con un solo comando la memoria, CPU y el estado del sistema de entrada y salida (I/O) consumido por cada proceso, disponemos del comando vmstat, que nos informa sobre estos datos de forma resumida. free es otro comando que nos informa sobre la memoria total, la swap y los buffer de caché. Si a free le pasamos el argumento -m la información que nos devuelve será en MB, y si le pasamos el argumento -g nos la devolverá en GB. Otros comandos útiles serían: iostat, pmap -d, iptraf, netstat, y tcdump. Lee sus man para ampliar información sobre los mismos.



    About us: We provide a web-based service for healthcare professionals to present whole slide, radiology, and clinical images in a unique and meaningful way. Current presentations, tumor boards, or transporting of medical images is cumbersome. Each path a patient takes on their journey through patient care deserves to have the highest caliber of investigation. Using PathPresenter will create a seamless environment for you to present de-identified medical images, presentations and conferences.





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    Admin Eusalud

    Pathology Resident Wiki: Pathology Links

    The Pathology Resident Wiki!
    The wiki about Pathology that anyone can edit.

    Pathology Links


    An online pathology resource for surgical pathology trainees across the globe

    An online pathology resource for surgical pathology trainees across the globe: Path-o-Blog, Path-o-Snap and Links.


    Reunión anual 2010 del Club de IAP

    Hola a todos:

    Se ha convocado la próxima reunión administrativa del Club de IAP para el próximo día 4 de 15:30 a 17:30 en el Hotel Rafael de Madrid. La junta directiva de la SEAP ha propuesto la fusión de nuestro club de informática con el club de gestion y calidad. Se discutirán los detalles, y quizá un cambio de nombre del club.

    Un saludo
    E. Moro

    Reunión no-ordinaria 3 Abril 2009 en Valencia

    Estimados compañeros/as del Club de Informática Aplicada de la SEAP

    Estamos preparando un reunión no-ordinaria del club para el día 3 de abril. Ese día se celebra por la mañana la Reunión de la Asociación Territorial Valenciana de la SEAP en la Fundación Oftalmológica del Mediterráneo (FOM) de Valencia, y hemos pensado añadir a la jornada en el mismo lugar una sesión de tarde dedicada exclusivamente a temas del Club.

    Tenéis un programa provisional es esta web:

    Este mensaje es para invitaros a todos los interesados a asistir. El programa está abierto a otras intervenciones por lo tanto si deseáis presentar algo poneos en contacto conmigo. Para dar agilidad a la sesión hemos planeado presentaciones breves de 15-20 minutos.

    Confiando veros por Valencia recibid un fuerte abrazo

    Luis Alfaro Ferreres
    Coordinador del Club de Informática de la SEAP

    Revistas de Patología

    Pathpedia: Pathology journals

    Admin Eusalud

    Sesión del Club de Patología Digital en el XXV Congreso de la SEAP

    La Patología en la Era Digital

    Coordinador: Luis Alfaro

    - Programa provisional - 18 de mayo de 2011 14:30 a 16:30


    1.- Enrique Poblet. Universidad de Albacete: Aplicación del programa de control de calidad de la SEAP.
    2.- Ernesto Moro y Enrique Poblet. Universidad Rey Juan Carlos. Alcorcón. Madrid: Preparaciones virtuales para prácticas de alumnos de grado.
    3.- Manu Manrique. Director del Portal Cooperación Internacional y Patología en la Era Digital.
    4.- Marcial García Rojo. Hospital de General Ciudad Real: Pacientes, patólogos y patología digital, el bueno, el feo y el malo.
    5.- Antonio Félix Conde, Miguel Sánchez Ramos y María Jesús Coma del Corral. Hospital Infanta Cristina de Badajoz: Presentación de la nueva web para el Foro de Diagnóstico por Imagen Pat-UniNet
    6.- Luis Alfaro. Hospital Virgen del Consuelo de Valencia: Patología Macroscópica en la Era Digital.


    Club de Patología Digital de la SEAP

    Para darse de alta como miembros del club: Rellenad el siguiente formulario de alta, o bien enviad un mensaje de correo a la siguiente dirección:

    Indicando en el asunto del mensaje: ALTA

    y a continuación en el texto:

    - Nombre completo
    - Hospital o centro de trabajo
    - Dirección postal
    - Correo electrónico
    - Teléfono
    - Número de socio de la SEAP

    Para la pertenencia como miembros de pleno derecho de los clubes es necesario estar dado de alta en la SEAP. Sin embargo, aquellos interesados en las actividades y funciones del club de Informática, pueden inscribirse también como miembros asociados si no pertenezcan a la SEAP, o no son patólogos.

    Luis Alfaro
    Coordinador del Club de Patología Digital de la SEAP

    Simposio satélite de Patología Digital

    Simposio satelite de Patología Digital Patrocinado por GE Healthcare"

    Simposio satélite de Patología Digital

    Hotel Rafael Atocha, Madrid, 29 de mayo de 2014

    Organiza: General Electric Healthcare

    [Programa] [Descargar PDF] [Inscripción]

    10:00-10:10 Introducción y presentación
    Dr. Miguel Angel Piris. Presidente de la Sociedad Española de Anatomía Patológica
    Dr. Marcial Gº Rojo. UGC Anatomía Patológica. Hospital de Jerez de la Frontera

    10:10-10:45 Tecnología de la imagen digital: escaneado, compresión e imagen en Anatomía Patológica

    10:10-10:30 Escaneando preparaciones digitales.
    Dr. Marcial Gº Rojo. UGC Anatomía Patológica
    Hospital de Jerez de la Frontera

    10:30-10:45 Compresión y formatos de imagen
    Profesor Raghavan Venugopal, Gerente de Investigación y Desarrollo de Software en Omnyx LLC (Empresa conjunta GE Healthcare y Centro Médico de la Universidad de Pittsburgh)

    10:50-11:30 Componentes necesarios para abordar con éxito un proyecto de Anatomía Patológica

    10:50-11:10 Elementos que permiten configurar una rutina digital en el Servicio de Anatomía Patológica.
    Miguel Angel Trapero, Jefe del área de Diagnóstico por Imagen
    del Hospital Universitario Fundación Alcorcón

    11:10-11:30 La integración de los Sistemas de imagen en el entorno del laboratorio.
    Profesor Raghavan Venugopal, Gerente de Investigación y Desarrollo de Software en Omnyx LLC (Empresa conjunta GE Healthcare y Centro Médico de la Universidad de Pittsburgh)

    11:30-12:00 PAUSA CAFÉ

    12:00-12:30 Factores que facilitan la introducción de la patología digital y factores que la dificultan.
    Dr. Sergi Serrano. Catedrático y jefe de Servicio de Anatomía Patológica. Hospital del Mar

    12:30-13:30 Experiencias con soluciones de Patología Digital.

    12:30-13:00 La elección de una solución digital para la Comisión de
    Tumores en la Fundación Althaia.
    Dr. Badal. Servicios de Patología y Fundación Althaia (Manresa)

    13:00-13:30 La experiencia de Coventry, UK,
    Dr. David Snead. Histopatólogo y Jefe de servicios clínicos en CWPS

    Surgical Pathology Criteria

    Surgical Pathology Criteria is focused on the presentation of useful diagnostic, grading and staging criteria in an accessible format.

    The site is designed for use by pathologists in practice
    Enter via either of two methods:



    Tumor of the Abdominal Cavity in a Woman of 28 year old.

    TUMOR DE CAVIDAD ABDOMINAL EN MUJER DE 28 AÑOS./ Tumor of the Abdominal Cavity in a Woman of 28 year old. - [Pat - Uninet]



    The history of pathology informatics

    The history of pathology informatics: A global perspective

    Seung Park, Anil V. Parwani, Raymond D. Aller, Lech Banach, Michael J. Becich, Stephan Borkenfeld, Alexis B. Carter, Bruce A. Friedman, Marcial Garcia Rojo, Andrew Georgiou, Gian Kayser, Klaus Kayser, Michael Legg, Christopher Naugler, Takashi Sawai, Hal Weiner, Dennis Winsten, and Liron Pantanowitz

    Abstract: Pathology informatics has evolved to varying levels around the world. The history of pathology informatics in different countries is a tale with many dimensions. At first glance, it is the familiar story of individuals solving problems that arise in their clinical practice to enhance efficiency, better manage (e.g., digitize) laboratory information, as well as exploit emerging information technologies. Under the surface, however, lie powerful resource, regulatory, and societal forces that helped shape our discipline into what it is today. In this monograph, for the first time in the history of our discipline, we collectively perform a global review of the field of pathology informatics. In doing so, we illustrate how general far-reaching trends such as the advent of computers, the Internet and digital imaging have affected pathology informatics in the world at large. Major drivers in the field included the need for pathologists to comply with national standards for health information technology and telepathology applications to meet the scarcity of pathology services and trained people in certain countries. Following trials by a multitude of investigators, not all of them successful, it is apparent that innovation alone did not assure the success of many informatics tools and solutions. Common, ongoing barriers to the widespread adoption of informatics devices include poor information technology infrastructure in undeveloped areas, the cost of technology, and regulatory issues. This review offers a deeper understanding of how pathology informatics historically developed and provides insights into what the promising future might hold.

    PMC: 3714902

    J Pathol Inform. 2013; 4: 7. May 30, 2013. doi: 10.4103/2153-3539.112689

    Tumor Intestinal Ulcerado

    Tumor Intestinal Ulcerado - [Pat - Uninet]

    Tumores Cutáneos Múltilples en Paciente Masculino con antecedente de Tumor Testicular.

    Tumores Cutáneos Múltilples en Paciente Masculino con antecedente de Tumor Testicular. - [Pat - Uninet]

    V Curso de Patología Digital

    V Curso de Patología Digital

    Lugar de celebración:
    Oporto, Portugal
    Fecha de inicio:
    26 de octubre de 2016
    Fecha de finalización:
    28 de octubre de 2016
    Más información:
    El V Curso de Patología Digital, se celebra en Oporto, Portugal, los días 26 al 28 de octubre de 2016, bajo los auspicios científicos del Club de Patología Digital de la Sociedad Española de Anatomía Patológica (SEAP).
    Gracias al entusiasmo y colaboración de los compañeros de Ipatimup (Instituto de Patologia e Imunologia Molecular e Celular da Universidade do Porto,, esta nueva edición tendrá lugar por primera vez fuera de España, en este caso, con el fin de incrementar las ya excelentes relaciones entre patólogos portugueses y españoles y crear vínculos de colaboración entre España y Portugal. Esto permitirá demostrar de forma efectiva que la patología digital no sólo rompe barreras organizativas y tecnológicas sino que permite crear redes de profesionales de diferentes países europeos que, apoyándose en una tecnología de imagen cada vez más avanzada, son capaces de ayudarse mutuamente.
    Otra de las novedades importantes de este año será la colaboración del proyecto Europeo AIDPATH ( en la organización del curso, permitiendo la participación de ponentes de primer nivel europeo
    En el V Curso de Patología Digital se presta atención especial a los temas de calidad de la imagen digital y el análisis de imagen automatizado. También se abordarán de forma detallada los avances tecnológicos en patología digital.
    En esta edición se mantienen los talleres prácticos, que tanto éxito tuvieron en la III edición anterior, en los que los asistentes podrán realizar ejercicios prácticos usando el ordenador, bajo la supervisión y guía del profesor del curso.
    Estamos seguros que todos los asistentes disfrutarán del magnífico entorno que ofrece Oporto.
    Enlace web

    Virtual Pathology at the University of Leeds :: Teaching

    The Virtual Pathology at the University of Leeds

    Virtual Pathology en la Universidad de Leeds

    The Virtual Pathology team at Leeds is dedicated to high quality digital slide scanning, hosting and research, with our data centre currently able to store 100TB of digital slide data.


    Virtual Slides University of Paris


    This Virtual-slides website has been developed in a partnership between University Paris Diderot and Hôpital St. Louis in Paris.

    Its aim is to promote the use of microscopic virtual slides for students, teachers, researchers and clinicians.

    Courses and pathology atlases are available in open access.

    Admin Eusalud


    About Visuals Online

    General Information: The National Cancer Institute's (NCI) Visuals Online provides a range of photographs and illustrations that may help communicators of medical and public health convey meaning, describe concepts, and tell stories. The collection spans everything from biomedical, science, and patient-care related illustrations and images to portraits of present and past directors and the staff of the National Cancer Institute. Visuals Online currently provides public access to 3,021 images.

    Photos and Images: NCI contracts with or buys images from professional photographers or purchases stock images. In cases where NCI sends a photographer on a public shoot, the photographer is required to get a signed release form from any subject who is recognizable to avoid invasion of privacy issues, and we do our best to obtain adequate authorization. The photographer typically does not photograph other individuals who would likely trade on their image commercially.

    Use of Images: Each image or illustration included in the NCI Visuals Online Web site is labeled either "Public Domain" (free to use) or "Copyright Protected" (restricted, obtain permission before use).

    Most of the images available in this library are in the public domain and are not subject to copyright restrictions. No special permission is required to use or reproduce public domain images. However, ANY reproduced images should acknowledge NCI as the originator, the NCI Web site,, as the source and/or the image creator. The source can be cited as: The Web site of the National Cancer Institute (

    Some images are copyright protected. If an image is marked as copyright protected, you must contact the rights holder to obtain permission to reuse. Contact information for reuse is posted at the bottom of the details page for each copyrighted image. Permissions, including credit line and/or fees for use of privately owned material, must be negotiated directly with the private-sector contractor, independent of the government. NCI does not have the authority to grant usage for any copyrighted images in this library.

    Fuente: VisualOnLine.Cancer.Org

    Whole Slide Viewer Zoom

    microDimensions Zoom

    microDimensions Zoom is a free of charge digital pathology viewer for fast visualization of whole slide images. It supports an unlimited number of channels and all major proprietary as well as generic file formats. It is a lightweight piece of software to easily and quickly view, share, and discuss cases.

    Zoom — Free Digital Pathology Viewer

    Fuente: TissuePathology - 2015/04/16

    X Congreso Virtual Hispanoamericano de Anatomía Patológica

    X Congreso Virtual Hispanoamericano de Anatomía Patológica

    En Santander, a 5 de Febrero de 2009.

    Estimados colegas: iniciamos esta apasionante andadura que es la organización de un Congreso Virtual de Anatomía Patológica esperando que os resulte interesante.

    La dirección:

    En esta fecha nos encontramos en una fase muy preliminar de la organización y, en consecuencia, todo lo que anunciamos hoy debe ser considerado provisional, sujeto a cambios.

    El cronograma provisional que intentaremos cumplir es el siguiente:

    - Enero-Febrero 2009: Planificación, diseño y difusión de la información.
    - A partir de Marzo 2009: Inscripción.
    - Marzo-Septiembre 2009: Recepción y maquetación web de los trabajos.
    - Octubre 2009: Finalización de los preparativos de las actividades científicas.
    - Del 1 al 30 de Noviembre de 2009: Congreso.

    Hemos pensado que el Congreso debe estar centrado en los apartados clásicos de la especialidad, Patología Quirúrgica, Patología Autópsica y Citopatología.

    Hemos añadido un cuarto apartado, al que denominamos "Otras disciplinas de actualidad" que completa el espectro de nuestra especialidad. Está dedicado a las novedades en temas esencialmente técnicos y metodológicos, así como los relacionados con la docencia, la investigación básica y la gestión. Caben aquí por tanto la patología experimental, la informática médica, los aspectos de la patología molecular, inmunohistoquímica o microscopía electrónica, que no quepan en los apartados clásicos, etc. etc.

    Cada apartado se estructurará en ponencias o conferencias y comunicaciones, con sus foros de discusión respectivos.

    Como en otras ediciones intentaremos potenciar la participación de los técnicos de laboratorio, pero esta vez lo haremos integrando sus aportaciones en el Congreso.

    Intentaremos también que el área de descanso de esta edición del Congreso sea tan entretenida como en ediciones anteriores. También intentaremos que la industria participe en este Congreso mediante una Feria Virtual.

    Una lista de los Coordinadores provisionales de cada uno de estos apartados, así como la descripción de sus funciones podéis verla en el apartado Comités.

    Durante los preparativos y durante la realización del Congreso es muy posible que necesitemos la colaboración de Voluntarios que nos echen una mano en labores sencillas, pero muy numerosas, como son el formateo de las comunicaciones libres, seguimiento de los debates, etc. etc. así como en aquellos aspectos que los Coordinadores de los Comités puedan demandar. En el momento oportuno abriremos un plazo para que os apuntéis. Podéis estar seguros de que os lo agradeceremos.

    Este es a grandes rasgos el planteamiento inicial. Esperamos que os guste. Si queréis nos podéis hacer las sugerencias que estiméis oportunas utilizando el foro a ellas dedicado.

    Hasta pronto

    Coordinación General:
    Fidel Fernández Fernández
    Luis Buelta Carrillo

    Foro de Patología Digital

    Bienvenida al Foro del Club de Informática Aplicada de la SEAP

    Abrimos el Foro del Club. Con este mensaje aprovecho para dar a todos los miembros del Club la bienvenida a este nuevo medio de expresión que espero sea de vuesto interés.

    Recibir un cordial saludo
    E. Moro Rodríguez